En 1943, luego de casarse con Cheddi Jagan, la pareja decidió mudarse a la entonces Guayana Británica.
También trabajó en la clínica dental de Cheddi Jagan durante diez años.
El 1 de enero de 1950, cuando ella y su marido fueron cofundadores del Partido Progresista Popular (PPP) al fusionarse con el Partido Laborista local, Janet fue elegida Secretaria General del PPP, cargo que mantuvo desde 1950 hasta 1970.
Su partido era marxista-leninista, opuesto al régimen colonial británico; luego de su victoria en las elecciones, las autoridades coloniales decidieron derrocar del gobierno al PPP debido a temores de que los Jagan buscasen alianzas con países comunistas.
Ella representó a Guyana ante las ONU durante tres meses en 1993, reemplazando temporalmente a Rudy Insanally, cuando este fue presidente de la Asamblea General de las Naciones Unidas.
Janet Jagan estuvo muy involucrada en la vida literaria y cultural de Guyana.
De regreso a Guyana, recibió medicamentos para el corazón y le dijeron que eludir la cirugía no era necesario.
Designó al hasta entonces ministro de Finanzas Bharrat Jagdeo como su sucesor.
En las elecciones internas del PPP, el 29 de agosto, logró alcanzar un escaño el Congreso.