para la transliteración de la lengua japonesa al alfabeto latino, sistema que popularizó en su diccionario japonés-inglés.
Después de cinco años como misionero, regresó a los Estados Unidos en 1845 y abrió un consultorio médico en Nueva York.
Más tarde fundó la Escuela de Hepburn, que se desarrolló en la Universidad Meiji Gakuin.
Los alumnos japoneses de Hepburn incluyen a Furuya Sakuzaemon, Korekiyo Takahashi, y Numa Morikazu (沼 间 守 一).
Este sistema es ampliamente conocido como romanización Hepburn, debido a la fama proveniente del diccionario.