Tiene su base en el edificio de Japan Airlines en Shinagawa, Tokio, Japón,[1][2] JALways opera más de doscientos vuelos cada semana, con vuelos regulares diarios desde tres aeropuertos en Japón a Bangkok, Manila, Denpasar, Guam, Honolulú y Kona así como vuelos regulares internacionales de Japan Airlines.Su base de operaciones principal es el Aeropuerto Internacional Narita, Tokio.[3] Las operaciones comenzaron con aviones McDonnell Douglas DC-10 y Boeing 747, pero los DC-10 fueron retirados en octubre de 2005.[4] JALways contrató pilotos extranjeros, principalmente americanos, desde su concepción hasta marzo de 2009.Los pilotos actuales son todos japoneses y procedentes de Japan Airlines.