Joseph Franz Freiherr von Jacquin, o barón Joseph von Jacquin (7 de febrero de 1766, Schemnitz (actual Banská Štiavnica) - 26 de octubre de 1839, Viena) fue un científico austríaco que estudió medicina, química y botánica.

Hijo de Nikolaus von Jacquin, se gradúa en la Universidad de Viena con un doctorado en medicina, en 1788.

Entre 1788 y 1791 Jacquin realiza exploraciones en una expedición científica a Alemania, Francia, Inglaterra, por orden del Emperador Frances II.

Al retiro de su padre, asciende a su posición como profesor de Botánica y Química en la Universidad de Viena, desde 1797 hasta su retiro en 1838.

La forma femenina es Freifrau y Freiin.