Esta técnica, habitualmente denominada electroenfoque, se emplea ampliamente en bioquímica para separar moléculas cargadas.Las moléculas anfotéricas, como los aminoácidos, se separan en un medio en el que existe una diferencia de potencial y un gradiente de pH.Las sustancias que inicialmente se encuentran en regiones de pH inferior a su punto isoeléctrico estarán cargadas positivamente y migraran hacia el cátodo, mientras aquellas que se encuentran en medios con pH más altos que su punto isoeléctrico tendrán carga negativa y migrarán hacia el ánodo.La migración las conducirá a una región donde el pH coincidirá con su punto isoléctrico, tendrán una carga neta nula y se detendrán.De esta forma las moléculas anfotéricas se sitúan en estrechas bandas donde coincide su punto isoeléctrico con el pH.
