Posteriormente trabajaría como auxiliar técnico de Ricardo La Volpe en el Toluca, logrando el campeonato del Apertura 2002.

Después sería auxiliar de Rubén Omar Romano en los equipos Monarcas Morelia y Cruz Azul.

Con el cuadro cementero asumiría el cargo de director técnico interino, debido a que Rubén Omar Romano sufrió un secuestro, manteniendo al equipo en los primeros lugares con un gran trabajo.

En el Apertura 2006 inició con cuatro victorias consecutivas, para después hilar una racha negativa de siete juegos sin ganar, y luego retomar el paso ganador con un gran cierre de torneo y calificando a Cruz Azul en la Liguilla como líder general.

En el torneo de Clausura 2007, Mizrahi calificó a su equipo nuevamente en la Liguilla, ocupando el cuarto lugar general.