Como antecedente, durante 1999 y 2000, Jorge Rial condujo Paf!, un programa de espectáculos nocturno similar a Intrusos tanto en temática como en formato, emitido también por América.

Su estilo desenfadado y su cuota de humor ácido hicieron desde un principio del programa un éxito.

Al conductor lo acompañan panelistas, en sus inicios Luis Ventura, Viviana Canosa, Marcela Coronel, Camilo García y Sergio Company.

Durante el verano de 2002, debido al éxito del programa, se realizaron varios especiales nocturnos titulados Intrusos en la noche.

El equipo originalmente era conformado por Rial, Viviana Canosa, Marcela Coronel, Camilo García y Analía Franchín.

También en ese mismo año se realizó una edición dominical llamada La Selección, con los panelistas de Intrusos y sin el conductor del programa diario.

A finales de 2002, la panelista Viviana Canosa se separó del elenco por problemas con el equipo.

Beto Casella fue su reemplazante y cocondujo junto a Ventura las últimas emisiones del año 2003.

Se instaló un nuevo estilo de locución con micrófono abierto permanentemente y su voz en off introduciendo comentarios.

El programa nocturno se extendió hasta septiembre del mismo año, para cederle el lugar a Polémica en el bar trasnoche.

Durante toda la emisión se recordaron primicias y peleas históricas de las temporadas anteriores.