Se trata de uno de los retos científicos más importantes del siglo XXI, como lo demuestran nuevas iniciativas globales para secuenciar los genomas de todas las especies conocidas y descubrir el 80 por ciento restante de las especies actualmente desconocidas, incluyendo el Earth Biogenome Project.

Con este objetivo, la investigación del IBE emplea las nuevas herramientas disponibles, experimentales y computacionales, para comprender el funcionamiento básico de la vida, descubrir los mecanismos de generación de innovaciones biológicas y preservar la biodiversidad y promover su gestión de manera sostenible.

El IBE es el único centro de investigación de Cataluña y del resto del Estado que se dedica íntegramente a la biología evolutiva, y es un referente en este campo en el sur de Europa.

La actividad científica del IBE se organiza en 5 programas de investigación interrelacionados: El máximo órgano de gobierno del IBE es su patronato, compuesto por dos representantes de ambas instituciones colaboradoras (CSIC-UPF).

En febrero de 2017 le sucedió en el cargo el Dr. Tomàs Marquès-Bonet como director del centro.