Nirvana pretendía que esta grabación sonara diferente a la pulida producción de su anterior álbum, Nevermind (1991).

Este rehusó modificar aún más el álbum, por lo que al final la banda contrató a Scott Litt para hacer cambios menores en el sonido del álbum y volver a mezclar los sencillos «Heart-Shaped Box» y «All Apologies».

Si bien no tuvo el mismo nivel de ventas que Nevermind, In Utero entró, tras su lanzamiento, en el número 1 del Billboard 200 y recibió los elogios de la crítica por suponer un cambio drástico con respecto a su anterior álbum.

Nirvana irrumpió en la escena musical comercial con su segundo álbum de estudio —y debut en una discográfica grande— Nevermind, en 1991.

[6]​ Sin embargo, los miembros de Nirvana expresaron más tarde su descontento con el sonido del exitoso álbum, refiriéndose a su producción como demasiado pulida.

Al nuevo productor de la banda le precedía una buena reputación en la escena musical independiente estadounidense.

[18]​ Los componentes de Nirvana y Albini decidieron fijarse dos semanas para la grabación del álbum.

[20]​ Nirvana se alojó en una casa situada en el recinto del estudio durante las sesiones de grabación.

Novoselic comparó las condiciones de aislamiento con un gulag y añadió que «afuera estaba todo nevado, no podíamos ir a ninguna parte.

[24]​ Las sesiones de grabación para el álbum comenzaron lentamente pero se desarrollaron intensamente en su recta final.

[22]​ La banda utilizó esta organización en todas las canciones excepto en cortes más rápidos como «Very Ape» y «tourette's», en las que la batería fue grabada por separado en una cocina cercana por su reverberación natural.

En ocasiones, cuando el trabajo en la mezcla de una canción no daba los efectos deseados, la banda y Albini se tomaban el resto del día libre para contemplar vídeos de naturaleza o hacer bromas telefónicas para divertirse.

Es como si [Cobain] hubiera renunciado a tratar de fusionar sus instintos punk y pop en un todo armonioso.

Con canciones como «Frances Farmer Will Have Her Revenge on Seattle», Cobain favoreció el uso de títulos más extensos en contraste con las bandas de rock alternativo coetáneas que utilizaban títulos más sencillos para las canciones.

[31]​ Cobain se inspiró en los libros que había leído para algunas de las canciones del álbum.

[39]​ Cobain declaró en una entrevista concedida a The Observer en 1993 que «en su mayor parte [de In Utero], es muy impersonal».

[40]​ El compositor y cantante afirmó también, en una entrevista a la revista Q, ese año que la abundancia de menciones de niños y nacimientos en el álbum, a la vez que su recién estrenada paternidad, eran simples coincidencias.

Cobain estaba molesto y dijo a Azerrad: «Debería volver a grabar este disco y hacer lo mismo que hicimos el año pasado porque lo vendimos todo, no hay razón para intentar redimirnos como artistas en este momento.

Este es exactamente el tipo de disco que compraría si fuese un seguidor, disfrutaría teniéndolo».

Novoselic quedó satisfecho con los resultados, pero Cobain no estaba convencido de que el sonido fuera todavía perfecto.

Aunque son ellos cantando y tocando sus canciones, la calidad musical final se hace patente».

[76]​ A diferencia del anterior álbum, DGC no lanzó comercialmente ningún sencillo de In Utero en Estados Unidos.

[81]​ Mientras tanto, cadenas de tiendas minoristas como Wal-Mart y Kmart rehusaron vender el álbum.

[82]​ En realidad, ambos establecimientos temían que los clientes se pudieran sentir ofendidos por el diseño de la contraportada.

DGC lanzó una nueva versión del álbum rediseñada y en marzo de 1994 ya estaba en las tiendas.

[87]​[88]​ Además, The New York Times lo incluyó en su lista de los diez mejores álbumes del año.

En octubre de ese mismo año, Nirvana se embarcó en su primera gira estadounidense en dos años para promocionar el álbum.

[91]​ En diciembre lanzaron en el Reino Unido un segundo sencillo que consistía en un split de «All Apologies» y «Rape Me».

Cuenta con dos versiones remasterizadas y remezcladas del disco original, pistas adicionales que incluyen demos, el concierto Live & Loud que la banda brindó en diciembre de 1993 y las caras B originales del álbum.

[101]​ Para promocionar el álbum, se ofrecieron tatuajes gratis del logo de Nirvana.