La versión final fue grabada en febrero de 1993 por Steve Albini en Cannon Falls, Minnesota y presenta a Kera Schaley en el violonchelo.
Fue lanzado junto a «Rape Me» como el segundo sencillo del álbum, pero como ningún video musical fue hecho, se promocionó en MTV usando material de la reciente presentación de la banda en MTV Unplugged.
Sin embargo, por el tiempo que era grabada para In Utero, la canción había adoptado un tono más «oscuro», dándole cierta finalidad a letras como la línea del coro: «In the sun I feel as one - married/ buried» («En el sol me siento como uno - casado/enterrado»).
Pese a esta «oscuridad», la versión final aún tiene un toque pop, finalizando con la línea «All in all is all we are» («Al fin y al cabo es todo lo que somos»), cantada sobre el riff de la canción, que es acompañado por distorsión y por retroalimentación de guitarra, muy similar del mantra «Jai Guru Deva Om» que cierra «Across the Universe» de The Beatles.
Vale la pena destacar que Cobain dedicó «All Apologies» a su esposa Courtney Love y a su hija Frances Bean durante la conocida aparición de Nirvana en el Reading Festival de 1992.