En 2010, Vargas jugó para los GCL Cardinals, bateando .239/.317/.364 sin jonrones y 15 carreras impulsadas.

En 2012, dividió el año entre los novatos Johnson City Cardinals, Low-A Batavia Muckdogs y High-A Palm Beach Cardinals, registrando una línea de bateo de .314/.378/.443 con 4 jonrones y 32 carreras impulsadas.

[3]​ Pasó el resto del año con los Kane County Cougars Single-A, cortando .321/.385/.438 en 86 juegos.

En 2016, Vargas dividió el año entre High-A Visalia Rawhide, Double-A Mobile BayBears y Triple-A Reno Aces, registrando una línea de bateo de .305/.360/.400 con 6 jonrones y 37 carreras impulsadas.

[4]​ Vargas comenzó el 2017 con los Reno Aces y fue llamado a los Diamondbacks el 29 de junio.

En 2019, Vargas bateó .269/.299/.413 en 92 juegos para el club de las Grandes Ligas, anotando 6 jonrones y 24 carreras impulsadas.

Louis Cardinals y conectó un jonrón que empató el juego 1-1.

[10]​ Se unió a la lista activa del equipo el 7 de septiembre.

[18]​ Vargas se incorporó de inmediato al roster activo, su tercer equipo de la temporada, ocupando el lugar del infielder Domingo Leyba, quien fue designado para cesión.

[20]​ Fue transferido directamente a Triple-A Reno Aces el 22 de junio.