El proyecto inicial del templo contemplaba la construcción de un templo salón de una nave y una única torre en la fachada, pero posteriormente el proyecto se amplió para contemplar una iglesia de planta basilical que sigue el modelo francés con tres naves, sin crucero, con girola, capillas radiales sobre la girola y dos grandes torres en la fachada principal que miden 124,95 y 124,75 metros respectivamente.
Las torres están rematadas por piñones triangulares, como en el periodo románico, pero con agujas más afiladas.
Durante la Segunda Guerra Mundial, en la noche del 28 al 29 de marzo de 1942, la ciudad fue bombardeada por las fuerzas aliadas, que provocaron un incendio que afectó gravemente a la iglesia.
Esta iglesia ha estado unida al nombre de grandes organistas y compositores que han pasado por ella.
También pasaron como visitantes Georg Friedrich Händel y Johann Mattheson en 1703 y Johann Sebastian Bach también llegó a Lübeck, con 19 años, solo para escuchar a Buxtehude.