La iglesia es parte del monasterio franciscano en Cafarnaún.
Está dedicada a San Pedro, a quien los fieles católicos consideran el primer dirigente de la Iglesia.
Las excavaciones arqueológicas llevadas a cabo en este lugar, descubrieron otra capa de estructuras residenciales, sobre las que se construyó la primera mitad de una iglesia del primer siglo.
En el siglo V, en su lugar se construyó una iglesia octogonal.
En 1990, junto a los restos de estos antiguos templos fue construida una iglesia de peregrinación moderna.