Originalmente perteneció al convento del Santo Niño Perdido, fundado en 1573.

[1]​ El nombre actual se le otorgó en esa época.

[1]​ Debido a las Leyes de Reforma, en 1861 las monjas fueron obligadas a desalojar el convento y el claustro, y otros edificios relacionados con la iglesia se demolieron.

Su entrada principal se encuentra en un lado del edificio, como era común en los conventos en México, y sus portadas gemelas, de estilo neoclásico, se añadieron a principios del siglo XIX.

El cuadro de Nuestra Señora de Valvanera es del siglo XVII, esta pintura y las esculturas fueron donadas por la iglesia maronita.