En 2019, la iglesia informó tener 69 715 miembros bautizados[1] en más de 260 congregaciones locales, que se dividen en 14 senioratos (presbiterios) en toda la República Checa.
En ese momento, la mayoría de los checos (cerca del 85%) eran protestantes; había dos iglesias protestantes: la Iglesia utraquista husita (1431-1620) y la Hermanos Unidos (1457-1620).
(Esta última fue parcialmente renovada en la década de 1720 fuera del territorio checo como la Iglesia Morava).
Esta prohibición se mitigó en 1781 mediante la emisión de la Patente de Tolerancia que permitió las iglesias luterana y calvinista en la monarquía de los Habsburgo (sin embargo, la igualdad total con la fe católica y la igualdad ante la ley para los protestantes solo se obtuvieron hasta 1867, cuando se creó Austria-Hungría).
Sin embargo, otras iglesias menores aún estaban prohibidas hasta la fundación de Checoslovaquia en 1918.