Ouédraogo nació en Banfora, Alto Volta, territorio conocido actualmente como Burkina Faso.

Su primera película en recibir una distribución importante fue Yaaba, filme que ganó varios premios en festivales, incluido el Premio FIPRESCI en Cannes.

[5]​ El éxito de Yam Daabo y Tilaï generó presión en el director,[6]​ quien presentó de manera apresurada su siguiente película, Karim and Sala, en la edición número 12 del Festival Panafricano de Cine y Televisión de Uagadugú ante una pobre recepción y distribución.

Sus siguientes largometrajes fueron Le Cri du coeur (1994), Kini y Adams (1997), La Colère des dieux (2003) y Kato Kato (2006).

Recibió un funeral militar al que asistieron diversas figuras religiosas, políticas y artísticas.