Fundado en el siglo X según algunos autores,[1]​ fue posteriormente abandonado y los Doce Linajes fundaron en sus dependencias una casa de niños expósitos (trasladada desde el Hospital de Sancti-Spíritus que fue entregado al convento de agustinos que se hallaba contiguo).

En el siglo XVI, el cura de Santiago, Don Diego de Tordesillas, fundó la casa de la Doctrina, edificio que se situaba en la calle del mismo nombre, donde se criaba a los niños y se les enseñaba hasta que podían valerse por sí mismos.

Cuando el hospital fue abandonado hacia 1850, la iglesia fue desmantelada trasladando su arte mueble al Convento de la Merced convertido en el nuevo Hospicio, quedando únicamente la imagen del santo que era visitada el día de su festividad.

Nicolás Rabal, la describió en 1889 ya en ruinas aunque aún quedaba toda su estructura.

Por lo tanto se deduce que era una iglesia perteneciente al románico rural formada por una nave y ábside semicircular con cubierta de madera.