A fines del siglo XIX y principios del XX en Valparaíso no existía un Hospital Naval propio y la atención se realizaba en "Pabellón de Marina" del Hospital "San Juan de Dios de Valparaíso", actual Hospital Carlos van Buren.

En 1919 la situación se tornó insostenible dada la estrechez del recinto y a que debía ser desalojado por estar destinado a la reconstrucción de la sección de mujeres.

Es por ello que se realizó el proyecto del nuevo Hospital Naval.

En la concepción de diseño y arquitectura del nuevo edificio para el Hospital Naval, se recogieron aspectos que son propios de un establecimiento específico para las Fuerzas Armadas.

El nuevo Sistema de Salud Naval en 1996, dio existencia a los Centros Médicos Navales (C.M.N) de Villa Alemana, Viña del Mar y Valparaíso.