Según la clasificación del COI las siguientes especies forman parte del género Hieraaetus:[1] ITIS, por su lado, reconoce las siguientes especies:[2] La especie extinta Harpagornis moorei, conocida como águila de Haast, fue reclasificada como miembro de este género gracias a la evidencia de los análisis moleculares.
[3] Tradicionalmente se han ubicado dentro de este género una serie de águilas parecidas a las del género Aquila pero con menor tamaño.
[5] Esto creaba un problema taxonómico, ya que el águila calzada (Hieraaetus pennatus) es la especie tipo de Hieraaetus, y si se consideraba dentro del género Aquila, había que asignar al resto un nombre genérico diferente.
Se estableció además que Hieraaetus kienerii no pertenecía a ninguno de los dos grupos, y por lo tanto fue trasladado a un género nuevo: Lophotriorchis.
[5][7] Tradicionalmente, y también según la clasificación de Clements 6ª Edición (2009), Hieraaetus weiskei es en realidad una subespecie de Hieraaetus morphnoides.