Hesperocallis se ha clasificado tradicinalmente en Liliaceae pero hasta hace poco tiempo su relación filogenética era confusa.

Otras clasificaciones la incluían en su propia familia Hesperocallidaceae (como el no tan antiguo APG II en el 2003,[1]​ que dejaba la opción de tratarla en su propia familia o de incluirla en un Asparagaceae sensu lato) o Funkiaceae.

El APG III (2009[2]​) como el APWeb (2001 en adelante[3]​) la incluyen en la familia Asparagaceae.

Los últimos estudios moleculares han confirmado una relación cercana con Agave y su inclusión en la subfamilia Agavoideae (Asparagaceae) ha sido recomendada.

Los bulbos de Hesperocallis undulata son comidos por los pueblos nativos.