Beneficiario de becas Fullbright y Lowie para complementar sus estudios avanzados.
Sus reflexiones, muy críticas con la realidad social y política circundante, provocaron su execrable asesinato a manos de tres sicarios dentro del recinto universitario en el que investigó a lo largo de 25 años.
Y hasta allí llegaron los sicarios, quienes sacaron por la fuerza a Hernán.
Pasados varios minutos, los profesores e investigadores del INER que se encontraban en la sala de reuniones de esta oficina se dirigieron al sitio donde había sido abaleado Henao Delgado y lo encontraron aún con vida, pero falleció mientras era trasladado a la Policlínica Municipal.
Tras conocerse el asesinato del profesor Henao, comunidades estudiantiles en las principales ciudades entraron en suspensión de actividades académicas como forma de protesta por el asesinato del profesor Henao, así como por la desaparición del profesor Darío Betancourt Echeverry en Bogotá, este último suceso había ocurrido cuatro días antes del crimen del académico paisa.