Su padre era Friedrich Hermann Pauly, director de una mina, y su madre era Henriette Wintgens (o Wittgens).
[1] Pauly estudió para su habilitación en la Universidad de Würzburg, y fue nombrado profesor asistente en 1909.
Pauly se convirtió en miembro del Corpsschleifenträger der Lusatia Leipzig en 1922.
Encontró que un anillo de tirosina tomó dos moléculas del compuesto diazo para formar una bis-diazo-tirosina.
[7] Estos descubrimientos resultaron invaluables para el trabajo de Karl Landsteiner sobre inmunidad y alergia.