El servicio más rápido de Tokio a Shin-Hakodate-Hokuto dura aproximadamente 3 horas y 57 minutos.

Todos los asientos están reservados y no se permite fumar.

[6]​ A partir del 1 de marzo de 2005, el Hayabusa se combinó con el servicio Fuji entre Tokio y Moji, tras la interrupción del servicio Sakura, que anteriormente operaba conjuntamente con el Hayabusa.

El tren era arrastrado por una locomotora eléctrica JR West EF66 entre Tokio y Shimonoseki, una locomotora eléctrica JR Kyushu EF81-400 entre Shimonoseki y Moji (a través del túnel submarino Kanmon), y por una locomotora eléctrica JR Kyushu ED76 desde Moji hasta Kumamoto.

Estos servicios estaban limitados a una velocidad máxima de 300 km/h.