Facundo comenzó a jugar en el Racing Club de Avellaneda.

En 1956 debutó en la primera división de San Lorenzo de Almagro, justamente frente al club de sus inicios, convirtiendo un gol el día del debut, para la derrota por 5 a 2; en esa temporada disputó además otro partido más totalizando dos juegos.

La obtención del campeonato, le dio al club la clasificación a la Copa Libertadores de América en su primera edición de 1960, en la que logró acceder a semifinales, instancia en la que fue eliminado por Peñarol; en el torneo internacional, jugó 4 partidos y no convirtió goles.

Jugó en San Lorenzo hasta 1963, un total de 125 partidos y convirtió 28 goles.

En dicho torneo jugó dos partidos, contra Bulgaria en el que convirtió el gol del triunfo por 1 a 0, y en el partido final del grupo frente a Hungría.