Por otro lado, los colonos de Bahía o de Pernambuco estaban mucho más ligados a los portugueses que a los paulistas, que eran en su mayoría mestizos, y hablaban en tupí-guaraní.
Emboabas no eran sólo los portugueses sino cualquier persona que proviniese de otra colonia.
Con miedo a la venganza, los agresores huyeron hacia la selva, oponiendo resistencia apenas un pequeño grupo.
En 1708, tuvo lugar un inevitable choque, y los dos lados volvieron a guerrear.
Se hicieron varios intentos de llegar a un acuerdo, pero sin éxito.
Los emboabas se reunieron y proclamaron a Manuel Nunes Viana gobernador de la región minera.
Los paulistas contraatacaron y asediaron a 800 de sus enemigos en São João del-Rei, pero debido a las divisiones internas se rindieron después de luchar cuando llegaron los refuerzos emboabas.