En 1973 fue ordenado monje budista por Rempō Niwa, líder en aquel momento de la escuela Sōtō Zen.

[2]​ Cuatro años después, Niwa le otorgó la transmisión del Dharma, aceptándolo formalmente como uno de sus sucesores.

[4]​ Gudō Nishijima tuvo numerosos discípulos, algunos de ellos occidentales tales como Brad Warner, Mike Chodo Cross, Eric Jiun Romeluère, Gustav Ericsson, Michael Luetchford, Gil Alon, Pedro Kaiten Piquero, Yudo Jürgen Seggelke o Jundo Cohen.

Según Nishijima, Dōgen construyó cuidadosamente el Shōbōgenzō de acuerdo con una estructura cuádruple, en la que describió cada tema desde cuatro perspectivas diferentes.

La cuarta perspectiva es la realidad en sí misma, la cual, según Nishijima, no se puede contener en la filosofía o expresar con palabras, pero que Dōgen intentó sugerir de manera poética y simbólica.