Nacido en la república del Transvaal, era hijo de padres neerlandeses emigrados a Sudáfrica en 1888.

Licenciado con honores en 1909, siguió los estudios de arquitectura en Inglaterra, Francia e Italia donde se especializó en la arquitectura del Renacimiento y la de la Antigua Roma.

Moerdijk fue el primer sudafricano que se convirtió en miembro del Royal Institute of British Architects.

El monumento al voortrekker en Pretoria, está considerado como su obra maestra.

La Academia Sudafricana de Artes y Ciencias le nombró miembro honorario en 1936 y en 1950 la Universidad de Sudáfrica le nombró doctor honoris causa.