Después de diversas actividades en el cuidado pastoral y en cargos administrativos, Frey fue nombrado obispo de Savannah, Georgia por el Papa Pablo VI.
Los coconsagrantes fueron el obispo de Alejandría, Charles Pasquale Greco, y el obispo de Baton Rouge, Robert Emmet Tracy.
El 7 de noviembre de 1972 Frey fue nombrado obispo de Lafayette y el 7 de enero del año siguiente él fue introducido en el cargo.
Gerard Louis Frey aseguró la reorganización integral de la diócesis de Lafayette, pero también fue responsabilizado por el escándalo que rodeó al padre Gilbert Gauthe, quien fue condenado por abuso sexual infantil; la diócesis tuvo que liquidar por ello más de 20 millones de dólares en honorarios legales.
[1] Murió por causas naturales después de una larga enfermedad a los 93 años.