En 1994, y nuevamente desde 1997 hasta 2002, Giorgos Katrougalos fue asesor legal en el Ministerio de Educación.

En 2002 fue nombrado profesor de derecho público en la Universidad Demócrito de Tracia, donde también se desempeñó como decano del Departamento de Ciencias Políticas y Administración Social.

Katrougalos también ha trabajado como asesor de reformas legales en Uzbekistán, Albania, la República de Macedonia (hoy, Macedonia del Norte), Siria y Armenia.

Ha enseñado o dado conferencias como invitado ponente en, entre otros, NYU, Columbia University, Humboldt University, Roskilde University, LSE,Oxford (St Antony's College), Facultad de Derecho de Nueva Delhi.

En las elecciones europeas de 2014, Katrougalos fue elegido miembro del Parlamento Europeo con el partido SYRIZA.