Realizó numerosas observaciones del planeta Marte con un telescopio refractor de 11 cm fabricado por el destacado astrónomo y físico Joseph von Fraunhofer.

Fue una de las primeras veces que se usaba un refractor acromático para la observación planetaria, mejorando notablemente respecto a los reflectores anteriores.

Al igual que William Herschel, Kunowsky también llegó a la conclusión, que posteriormente se confirmó, de que los parches visibles en Marte eran elementos del asociados al terreno en lugar de ser nubes u otras características transitorias.

Observadores como Johann Hieronymus Schröter llegaron a la conclusión opuesta.

Kunowsky también realizó diversas observaciones la Luna, y fue uno de los astrónomos en descubrir de manera independiente el regreso del Cometa Halley en 1835.