Volvió a ganar la Segunda División en 1962, pero no pudo ascender ya que el campeón no ascendía en forma directa, debía jugar una promoción ante el último de la Primera División, esta promoción lo perdió ante el club Sol de América, que se mantuvo en la máxima categoría.

[7]​ Al final de la temporada debió retornar a la Segunda División, a pesar de una protesta presentada por un partido contra Independiente, la cual le debía haber permitido mantener la categoría.

En el Torneo Clausura llegó a la última fecha con buenas posibilidades de salvar la categoría, pues con una victoria aseguraba su permanencia, pero tras su derrota ante Libertad finalmente descendió.

En la temporada 2018, año en la que festejaba su Centenario, el club no tuvo un buen desempeño (principalmente en la segunda mitad del campeonato) y en la última fecha del campeonato tras perder 2-0 en condición de visitante ante Ovetense concretó su descenso a la Primera División B, por lo que volvió a competir en la tercera categoría del fútbol paraguayo tras 19 años.

Su muy bajo de desempeño determinó el descenso por vez primera en su historia a la cuarta categoría del fútbol paraguayo, pasando - por lo tanto- por los 4 niveles en sólo 5 años.