Este animal fue descrito y nombrado en 1974 por el paleontólogo francés Jacques Fabre, a un fósil que denominó como Gallodactylus canjuersensis.

[1]​ El holotipo, MNHN CNJ-71, consiste en un esqueleto casi completo de un individuo inmaduro.

Fabre notó de inmediato que la especie estaba estrechamente relacionada con otra ya conocida, Pterodactylus suevicus, y decidió removerlo del ya sobrecargado género Pterodactylus, trasladándolo a su nuevo género, de modo que sería renombrada como Gallodactylus suevicus.

Previamente Harry Govier Seeley en 1870 ya le había dado a P. suevicus un nuevo género: Cycnorhamphus.

Este nombre fue considerado por Felix Plieninger como inválido desde 1907, debido a que consideraba que Cycnorhamphus estaba basado en una supuesta mala descripción de los fósiles por Seeley y Fabre, guiándose por esa consideración, también dejó a un lado a Cycnorhamphus[2]​ En 1996, Christopher Bennett, sin embargo, determinó que ese nombre científico descrito, aunque fuera una mala descripción no invaliba la prioridad de Cycnorhamphus y por lo tanto, Bennett sinonimizó a Gallodactylus con Cycnorhamphus, y la especie tipo de Gallodactylus sería C. canjuersensis.