Actualmente GNUnet funciona bajo GNU/Linux, BSD, Mac OS X, Solaris y Windows.
Su principal aplicación es el anonimato y la resistencia a la censura, permitiendo que los usuarios publiquen u obtengan información anónimamente.
GNUnet ofrece la opción "topología Friend-to-friend" para restringir las conexiones únicamente a los nodos confiables del usuario.
Los nodos confiables del usuario (y demás) pueden intercambiar indirectamente archivos con la computadora del usuario, no usando su dirección IP directamente.
Los archivos intercambiados con GNUnet son codificados con ECRS (Encoding for Censorship-Resistant Sharing).