Actualmente forman parte del mando operacional conjunto de la UNOPES.
La FES está considerada entre las mejores unidades de operaciones especiales marítimas en el mundo, debido principalmente a su vasta experiencia en redadas contra el narcotráfico, las altas capacidades operativas y el alto grado de adiestramiento al que se encuentran sujetos sus operadores (en el interior de la nación y a través de cursos en el extranjero), el cual es usualmente proporcionado por otras unidades homólogas diferentes partes del mundo.
Las operaciones que desarrolla está unidad de la Armada de México son de carácter confidencial, por lo que permanecen fuera del conocimiento público, hasta que no hayan sido realizadas, y difundidas por medios de comunicación como su participación en la Operación Cisne Negro, por parte del Equipo Roble con integrantes como la gárgola, Matus entre otros, dicha operación terminó con la captura del famoso líder del Cartel de Sinaloa Joaquín Guzmán Loera "El Chapo".
El nivel tan exigente de preparación impuesto a los aspirantes a la FES, hace que solo un porcentaje de aspirantes (generalmente 20% o menos), logren finalizar el curso.
Asimismo, integrantes de esta unidad han sido entrenados por sus contrapartes en Estados Unidos, Actualmente la unidad cuenta con una baja cantidad de elementos en sus filas por lo que es difícil ver a estos elementos en operativos y los que son vistos están revueltos con tropas regulares como comandos o paracaidistas en España e Israel.