Es auxiliado por el Grupo de Trabajo Político-Militar (POLMIL WG, son las siglas en inglés).- El Comandante del Grupo Operativo de la EUROMARFOR (COMGRUEUROMARFOR) en el nivel táctico, subordinado al COMEUROMARFOR.Además, la fuerza puede incorporar unidades de países no-EUROMARFOR, sea para adiestramiento o para participar en operaciones.Los periodos en la mar para operaciones o ejercicios se han ido incrementando año tras año, junto con la participación en varias misiones relevantes (a pesar de ser una organización relativamente joven) incluyendo el despliegue en tres operaciones reales.En la Operación Coherent Behaviour la EMF trabajó en estrecha colaboración con las autoridades OTAN, en la misma área que la Operación Active Endeavour y con el mismo propósito (obtención de inteligencia, vigilancia y reconocimiento) desde octubre a noviembre de 2002.Se puede considerar un despliegue histórico al ser la primera operación con componente naval liderada por Naciones Unidas y también por ser el primer despliegue de EMF bajo el paraguas de Naciones Unidas.Desde su creación, EUROMARFOR se ha activado durante 54 meses para operaciones (hasta diciembre de 2012).
