La frontera empieza al norte en el trifinio que se forma con las fronteras entre Bosnia y Herzegovina, Montenegro y Croacia.
Después se une al sur con las bocas de Kotor, que culmina a 1089 metros y pasa por el valle de Sutorina.
El territorio fronterizo en la península de Prevlaka y que controla el acceso de las bocas de Kotor fue ocupado por Yugoslavia desde el principio del conflicto contra la recién independizada Croacia en 1991.
Los presidentes croata y yugoslavo, Franjo Tuđman y Dobrica Ćosić aceptaron el 30 de septiembre de 1992 una declaración conjunta en Ginebra para desmilitarizar el área.
En el año 2002 se llegó a un acuerdo definitivo y la presencia de la ONU terminó el 15 de diciembre de ese año, desde entonces la península volvió a dominio croata.