El videojuego tiene lugar a finales del siglo XXI, donde los "superestados" compiten por los recursos del mundo, y dos personas son enviadas a investigar cuando cinco bases de una nación son atacadas sin provocación por personas desconocidas.

Estas acciones pueden ser "mover" o "atacar" y ambas requieren una cierta cantidad de AP para usarlas.

Al final de un turno completo, que consiste en una Player Phase y Enemy Phase (fase del jugador y fase del enemigo, respectivamente), una cantidad fija de AP se repone.

Además dos acciones especiales también se pueden realizar como acciones vinculadas: el antibloqueo y el Salvamento respectivamente, el Antibloqueo causa que los misiles dentro del alcance puedan perderse, mientras que el Salvamento restaura cualquier wanzers destruido en la batalla.

Las distintas superpotencias como los Estados Unidos del Nuevo Continente (USN), se negaron a importar sus recursos naturales, que son el motor económico más importante de su economía.

En el otro lado del mundo, Venezuela abruptamente declara su independencia de la USN.

En 2096, cinco bases militares en Alemania son atacadas simultáneamente por asaltantes desconocidos.

El equipo entrega el microchip a Niklas Glaeser, un general alemán que lidera la investigación.

Sin embargo, fueron descubiertos por el VSA y se ven obligados a escapar hacia el norte, a Cumaná, donde un hombre de negocios llamado Chang les ofrece ayuda para escapar.

Sin embargo, esto falla cuando son atacados por desconocidos wanzers en el puerto, que se extiende a la ciudad.

Darril decide ayudar a los aldeanos y, en el proceso, se encuentra con el grupo rebelde "Alianza de Libertad Venezolana".

Ivanovna escapa durante la escaramuza, pero mantiene un faro en el camión de los desertores creyendo que pueden ser útiles para ella en el futuro.

A medida que la trama del juego se complica, los protagonistas descubren que Glaeser mintió sobre la investigación y fragmenta sus conexiones entre los ataques de base en Alemania y los perseguidores de los desertores en Venezuela.

[10]​ En diciembre de 2003, Square Enix reveló un tráiler del videojuego junto a Front Mission: Online en el Jump Fest.

[14]​[15]​ El videojuego solo presentaba voz en off en inglés, y en Japón solo fue lanzado con subtítulos.

La banda sonora fue compuesta por Hidenori Iwasaki, con algunas pistas aportadas por Ryo Yamazaki.

La música ha sido descrita como muy diferente de la música de otros Front Mission, y como mucho más "abstracta y pesada" que la del videojuego anterior, mucho más similar a la música del primer videojuego con un énfasis en la melodía, así como la luz y los elementos temáticos.

La música del videojuego fue incluida junto a música de la nueva versión del primer Front Mission, y el álbum fue titulado Front Mission 4 plus 1st Original Soundtrack.

Prefiriendo las pistas de Front Mission 4 a las pistas del primer videojuego, elogió el álbum como "impresionante", especialmente teniendo en cuenta que era solo la "primera obra de un nuevo compositor prometedor".

[19]​[20]​ La reacción norteamericana al videojuego fue consistente en todos los ámbitos, recibiendo críticas generalmente buenas.