[1]​ Fischer estudió medicina, primero en Bonn, luego en Berlín y Leipzig.

Allí, participó en experimentos quirúrgicos llevados a cabo en prisioneros del campo de concentración, abriendo heridas en las piernas y agregando bacterias peligrosas infección por bacteria, en cuatro series de a cinco presos.

[2]​ Al finalizar la Segunda Guerra Mundial, fue procesado en el Juicio de los doctores en Núremberg, donde fue condenado a cadena perpetua.

En 1951, su sentencia fue reducida a 15 años y fue liberado en marzo de 1954.

Posteriormente, Fischer recuperó su licencia para practicar Medicina y empezó una nueva carrera en la compañía química Boehringer, en Ingelheim am Rhein, donde permaneció hasta su muerte en 2003.