En 1860 recibió su doctorado en medicina en Berlín, convirtiéndose en profesor de ginecología en Rostock en 1864.
[1] Entre sus estudiantes y asistentes en esta ciudad se encontraba el ginecólogo Joseph Albert Amann (1866-1919).
Su nombre sirve para denominar la "enfermedad de Winckel", una afección descrita originalmente en su forma epidémica en 1879, también conocida como "hemoglobinuria epidémica del recién nacido".
El nombre reconoce a Winckel junto con Justus Heinrich Wigand (1769-1817) y con August Martin (1847-1933).
Fue el primer presidente de la Deutschen Gesellschaft für Gynäkologie und Geburtshilfe (Sociedad Alemana de Ginecología y Obstetricia).