Francisco Javier Chavolla Ramos ingresó al Seminario Menor de Tijuana, B.C.N.

Posteriormente pasó al Seminario Mayor donde realizó sus estudios filosóficos en 1966.

Como sacerdote realizó varios cursos sobre Teología Espiritual en el Pontificio Instituto «Teresianum» de Roma y ha desempeñado los siguientes cargos: -Vicario cooperador en la parroquia de la Inmaculada Concepción en Tijuana, B.C.

Dentro la Conferencia del Episcopado ha sido encargado de la Comisión Episcopal para la Familia.

Las bulas se ejecutaron el 18 de noviembre del mismo año, tomando posesión.

En 2021, presentó su renuncia como lo establece el Código de Derecho Canónico.