Inició su carrera profesional en México donde jugó con varios equipos campeones de segunda división .

Autor de un doblete, el camerunés se mostró decisivo y permitió a los marroquíes alcanzar su cuarta final de la competición frente al Zamalek SC.

La temporada siguiente fue más complicada, François Endene no marcó su primer gol hasta febrero de 2003 en el campo del AS FAR.

En el verano de 2003, se unió al Chengdu Tiancheng, que entonces jugaba en la segunda división china.

Jugó uno el año pasado en Can Tho FC en 2011-2012 antes de retirarse del deporte.