La English Football League Two 2016-17 es la decimotercera temporada de la cuarta división inglesa, desde su creación en 2004.
Un total de 24 equipos participan en la competición, incluyendo 18 equipos de la temporada anterior, 2 que asciendan de la Conference National y 3 que desciendan de la Football League One 2015-16, a su vez los últimos 2 de esta temporada descenderán a la Conference National 2017-18.