Fue proyectado e impulsado por los doctores Oscar Guglielmone y Orestes Fiandra en los años ochenta.

[1]​ Su creación permitió el financiamiento de nuevas tecnologías médicas para el país, y al mismo tiempo, la democratización del acceso a ellas sin limitaciones económicas.

A través de dicho sistema, todas las instituciones públicas y privadas reaseguran a sus beneficiarios para situaciones médicas "catastróficas"; es decir, aquellas que por su alto costo y baja frecuencia podrían desfinanciar una institución.

Este nuevo texto incrementó la representación del sector privado en la conformación de la Comisión Honoraria Administradora y estableció la cobertura de tratamientos en el exterior cuando se cumplen determinadas condiciones.

A fin de llevar a cabo este cometido, se habilitó a suscribir convenios de gestión con las entidades públicas o privadas, estatales o no estatales, que tengan directamente a su cargo la asistencia médica de afiliados, beneficiarios o usuarios que sean asistidos en relación con afecciones técnicas o medicamentos con cobertura financiera del Fondo.

Han sido directores generales del Fondo Nacional de Recursos: