Florentino Ameghino es un municipio argentino de la provincia de Misiones, ubicado dentro del departamento San Javier.
Se halla a una latitud de 27°33′ S y a una longitud de 55°8′ O.
Las Rutas de acceso al municipio son 2: la principal es la ruta pcial N.º 5 que se encuentra asfaltada.
La otra posibilidad para acceder al municipio es a través de la ruta provincial 209 actualmente entoscada y buenas condiciones en la mayor parte de su tramo.
Otras rutas provinciales que atraviesan al municipio son la 231 que une a Florentino Ameghino con la ruta costera, y la 215 que nace en Gdor López, pasa por el municipio y termina en Panambí.