Poco más tarde, el videojuego comienza a comercializarse para otros sistemas operativos y ordenadores.
El simulador más tarde fue portado a la TRS-80 Modelo I, que solo poseía rudimentarias capacidades gráficas.
Aunque todavía llamado Flight Simulator II, se comercializó una versión para Amiga y Atari ST, tales versiones fueron una gran paso adelante que se comparan favorablemente con Microsoft Flight Simulator 3.0.
Los cuatro aviones fueron simulados los Gates Learjet 25, el Cessna Skylane, el Sopwith Camel y un planeador Schweizer.
Esto también hizo obsoletos todos los add-on paisajes y aeronaves para las versiones anteriores.
Las mejoras se hicieron a los modelos, incluidos aviones, el clima, el sistema de realismo e inteligencia artificial.
FS98 (6.1) se considera generalmente como un "Service Pack", que ofrece pequeñas mejoras, con una excepción notable: el simulador de ahora también incluyó un helicóptero (el Bell 206BIII JetRanger), así como una interfaz mejorada en general para añadir más aviones, escenarios , y sonidos.
A pesar de que muchos usuarios tenían grandes esperanzas cuando llegó esta versión, muchos estaban decepcionados cuando se descubrió que el simulador exigió mucho hardware; los requisitos mínimos son un Pentium 166 MHz, aunque 400-500 MHz se consideró necesario disponer para obtener una tasa de cuadros por segundo decente, se incluyó el Concorde y un Boeing 777-300.
FS2002 (8.0) fue la mayor mejora sobre versiones anteriores, se mejoraron los gráficos, incluyó también el ATC y tráfico aéreo gracias a la Inteligencia artificial, así como también la nueva vista de cabina virtual permitiéndole al usuario poder ver toda la cabina "girando la cabeza".
Los usuarios podrían volar junto los aviones controlados por computadora y comunicarse con los aeropuertos.
La profesional incluía nuevos aeropuertos destacados y era más pesada para instalarla en la PC.
Microsoft Flight Simulator X, o FSX, es la décima y la versión actual del simulador de vuelo.