[1] Se pueden realizar mediante la extirpación del conducto fistuloso y el tejido circundante, la simple división del canal, o la división gradual y el drenaje asistido de la vía en un setón.
En casos más complicados, es posible que el cirujano deba extraer parte de la fístula.
La fistulotomía se puede realizar en dos etapas en el caso de que se deba cortar una cantidad importante de músculo esfínter o si no se puede encontrar el conducto completo.
[2] Las fístulas pueden ocurrir en varias áreas del cuerpo humano, y la ubicación de la fístula influye en la necesidad del procedimiento.
Algunas, como las fístulas ano-vaginales y perianales son condiciones crónicas, y normalmente no se curarán sin intervención quirúrgica.