La Final de Ascenso 2005-06 fue una llave de definición en la cual se enfrentó el campeón del Torneo Apertura 2005: Puebla, contra el campeón del Torneo Clausura 2006: Querétaro, disputándose en partidos de ida y vuelta, para determinar al equipo que ascendería a la Primera División.

Disputarán el ascenso a la Primera División los campeones de los Torneos Apertura 2005 y Clausura 2006.

Si al término del tiempo reglamentario el partido está empatado, se agregarán dos tiempos extras de 15 minutos cada uno.

De persistir el empate en estos periodos, se procederá a lanzar tiros penales, hasta que resulte un vencedor.

Si el Club vencedor es el mismo en los dos Torneos, se producirá el ascenso automáticamente.