Federico Borromeo (Milán, 29 de mayo de 1617 - Roma, 18 de febrero de 1673) fue un cardenal italiano.
Hijo del conde de Arona Julio César Borromeo y de Giovanna Cesi, estudió teología y derecho civil y canónico antes de marchar a Roma en 1635.
Fue gobernador de Ascoli en 1643, de Benevento en 1646, inquisidor en Malta en 1652, Patriarca de Alejandría desde 1654, nuncio apostólico en Suiza entre 1654 y 1665, gobernador de Roma entre 1666 y 1668 y nuncio en España entre 1668 y 1670.
Este mismo año fue nombrado secretario de estado de la Santa Sede y creado cardenal en el consistorio de 22 de diciembre, recibiendo al año siguiente el capelo cardenalicio y el título de San Agustín, que en 1672 cambió por el de Sant'Agnese fuori le mura.
Muerto en Roma en 1673, fue enterrado en la iglesia de San Carlo al Corso.