Su principal misión es la de llevar a cabo la preparación de todas las selecciones nacionales del país, para que estas tengan el éxito deseado por la afición al fútbol en Honduras.

Esta Federación de Fútbol, se fundó a iniciativa del señor Pedro Atala Simón.

Sin embargo, este ente deportivo fue legal y totalmente reconocido hasta en 1984, cuando el congreso de la república de Honduras aprobó los estatutos y la reconoció como tal; a través del Ministerio de Educación y no del Ministerio de Cultura y Turismo como estaba contemplado en sus bases estatutarias.

Además de Pedro Atala Simón y Carlos Zapata han fungido como presidentes de este ente deportivo los señores: Jorge Abudoj Frixione, Rodrigo Castillo, Lisandro Flores Guillén, Roberto Córdova, Rafael Leonardo Callejas y electo en 2019, Jorge Salomón.

En la actualidad, este organismo cuenta con más de 40 árbitros capacitados para dirigir encuentros oficiales, entre ellos: Saíd Martínez Armando Castro Raúl Castro Oscar Moncada Héctor Rodríguez Melvin Matamoros Melissa Borjas Pastrana Nelson Salgado