El IPAE fue creado por la Asociación Promotora de Estudios Administrativos y Económicos de Misiones (APEAEM), organismo privado cuyos propulsores fueron productores, comerciantes, industriales y profesionales que vieron la imperiosa necesidad de preparar a la juventud para el despertar del potencial socioeconómico de la provincia.

Presidía el APEAEM el Sr. Humberto Pérez, siendo vicepresidente el Ingeniero Alejandro Malvicino.

Ernesto Seidel a quienes acompañaban como adjuntos conocidos profesionales de nuestro medio.

Poco tiempo después el IPAE creó la carrera de Secretariado Ejecutivo y tuvo que alquilar un edificio, sito en San Lorenzo 659, para poder desarrollar ambas carreras.

Cuando se crea la Universidad Nacional de Misiones gracias a las arduas gestiones del MOPUM (Movimiento Pro-Universidad de Misiones), el IPAE se incorpora a ella como Escuela de Administración.